ios5からwifiで同期するとのことですが、syncフォルダにzipフォルダを入れて同期するとありますが、パソコン側にsyncフォルダがありません。パソコン側にはcomicglassから指定されているソフトをDL済みです。同期の仕方がいまいちわからないので詳細に説明して欲しいです。

ちゃんとこのサイトに書いてます。
よく読んで。

説明がわかりづらく申し訳ありません。

ドキュメント類は今後充実させていきたいと思います。
よろしくお願いいたします。

http://comicglass.net/sync/ja.html