早速のiPad3対応版有難うございます。
ところでタイトルの件ですが、表紙一覧の画面での再生成は、高解像度の表紙サムネイルが作られるのですが、閲覧中のページから「表紙の設定」機能で作成したサムネイルの解像度が、大変低いものになっております。
ご確認のほどよろしくお願い致します。

ご不便おかけします。

次バージョンで修正いたします。