アプリ内に「ダウンロードフォルダはiTunesやiCloudと同期してもバックアップされない」という説明書きを見ました。
そこで質問なのですが、
1、ダウンロードフォルダ内に新規フォルダを作りその中にファイルを置いた場合はバックアップされるのでしょうか。
2、同期時にPCに書籍データ入りのアプリをバックアップさせたくない場合はダウンロードフォルダにデータを置く以外に何か方法はないでしょうか

よろしくお願いします。

ComicGlassをご利用頂きありがとうございます。

１について
ダウンロードフォルダ内のフォルダもバックアップ対象外です。
ダウンロードフォルダに含まれるものが全て対象外になります。
（ダウンロードファイルをバックアップ対象外にしているのは、アップルのガイドラインに準拠するためです）

２について
ダウンロードフォルダの外にあるフォルダについては、フォルダごとにバックアップ対象にするかどうかを選択できます。
フォルダ情報画面から変更してください。
（リスト表示の場合は右の青い矢印、本棚の場合はフォルダを長押しです）

よろしくお願いいたします。